《植物名实图考》在中国乃至世界植物学中具有重要地位，它已突破历代本草学仅限于性味用途的描述，而着重于植物的形态、生态习性、产地及繁殖方式的描述，大大丰富了植物学的内容。该书于道光二十八年(1848)刊印发行问世后，受到国内外植物学界和药物学界的高度重视。从植物学的发展来说，吴其濬的研究途径由实用向纯科学方面发展。《植物名实图考》的问世，从本草学的附庸，逐步走向独立科学的阶段，因而它在中国植物学史上占有重要地位。1880年，该书第二版印出后即传入日本，日本学者奉为珍宝，评价此书“辩论精博，综合众说，析异同，纠纰缪，皆凿凿有据，图书亦甚备，至其疑似难辨者，尤极详细精密”。《图考》在国际上也颇有影响。德国学者布瑞施奈德给该书极高评价，认为书中图谱“刻绘尤其精审”，“其精确程度往往可资以鉴定科或目甚至种”。他一再强调：“欧美植物学者研究中国植物必须一读《植物名实图考》 ”。美国学者劳佛和米瑞等，对该书也多有推崇。