总院设院部:政治委员胡明政，院长孟焕然，副院长邵达夫。委员有张克斌、陶庆红、夏长海、曾纪芥等。当时党、团组织都是秘密的。院部建有党委会，有党员20余人，书记胡明政，下分4个支部，有个支部书记叫赵全安。其中胡明政、邵达夫、张克斌都是由苏联回国后来医院工作的。共青团委员会有40多名团员，分8个小组，团委书记先后有郑世尧、方忠耀等。勤务员宋宝忠，伺马员有郑国才、张和右、张某某。院部还有通讯警卫排、收发室。通讯警卫排又分有线通讯和徒步通信，排长姓郭，班长有蔡思嘉等。

总院医务处:负责医务，下设看护队、卫生队、洗衣队、药房和药库。主任穆青峰、邢某某，医生先后有苏井观（建国后任中央卫生部副部长）、漆成栋、魏德贵、周光坦、曹学珍、方忠贤、吴子南、洪明玉、杨新武、王子元、姜子英、董某某、汪泽沛、周胡子（绰号，不知真名）、肖XX、黄XX等。看护队，相当于今日的护理部和护士班。有看护长杨泽亮（杨英华）、张映清，班长有范秀楼（范明）、阮竹青、姜存德。还有女护42人，男护31人。卫生队，又叫卫生科。协助看护工作，负责卫生、安置伤病员。队长林枫、吴麟周等。班长石和鼎、程怀明，队员有吴先清、等17人。洗衣队，又叫缝衣队。负责给伤病员浆洗缝补衣服等，负责人固定，洗衣员是根据任务大小，再从各乡轮派。甘良元为队长，洗衣员有徐子英等10人。药房药库工作人员，先后有程芳永等15人。

经理处:又叫行政处。负责经济收支及行政事务，下辖事务处、供管科、财务科、军需科、服务处、担架运输队、木工班、弹花班、理发班、还附设一个糕点作坊。经理主任戴道之，副官黄XX、游正刚、徐老幺，会计蔡春舫、黄绪竹，采买张厚江、石生意、石尚居（？）、郑XX、董XX等。事务处负责生活，并附设一个豆腐坊、粉坊、一个鸭棚。木工班负责制作医用拐杖及其他木器。弹花班制作医用棉花及被絮、垫褥等。理发班负责为伤病员理发。糕点作坊为医院制作糕点。

政治处:负责政治宣传，下辖组织科、宣传科、保卫科、青年科，主办有《显微镜报》，还主管“列宁室”，并附设一个宣传队。“列宁室”又叫俱乐部，即今日的文化室。政治处主任李锦文，组织科长林宛，宣传科长刘思宽，青年科长姓廖，俱乐部主任姓高，宣传员有戴文彬、肖XX等，宣传队长吴行金。