药王殿堂的雕饰包括了中国先哲生态智慧的广泛内容，“万物一体”、“生而不有”、“曲成万物”、“合而不同”、“大壮恒久”、“循环再生”等观念在这里都得到了形象的诠释。谐趣祥和的景观雕饰对人的吸引与调剂，足以让拜师求医的祷告者身临其境，豁然开朗，病忧顿释。画面中，清新和谐的生存格调，蕴示世间万事万物等生生自然，人与自然谐趣相处才能多姿多彩；人食禄（骑于鹿背）常常是在繁忙（弓腰急驰）之中；和谐的大自然是百宝充盈的大自然，其生灵相助，可善而择之，应有节制地取其宝物，服务于人类。所以，在供奉药王孙思邈的殿堂有联曰“药物素有灵苦无奇方治俗病，王侯高不任独操仁术救人危”，颂扬药王济世救人的功德和“医德千秋”的济世救人宗旨。领略如此惬意的雕琢景观和风趣达观的人生警句，病痛者必能释然而安。

药王拜殿与座殿间依势设有东西墙，墙面各设一墙门，东为造型门，上部嵌置一石匾，匾面阴刻“宗黄”二字；西门可出入，在入口处亦嵌置石匾，阴刻“武岐”二字，二匾的特殊寓意应该是：为医之道应法宗，即《黄帝内经》，遵从医德要效“岐”，即效法岐伯。历史记载，岐伯是黄帝时医德高尚的名医，《黄帝内经》正是黄帝与歧伯在探讨医理时的对话录。所以，古人称医学为“岐黄之术”不无道理。孙思邈效法岐伯医术，更敬重岐伯高尚的医德。有书记载，药王在谈论健身理论时，种论述过进补药与人健康的关系，感慨“德行不克，纵服玉液金丹，未能长寿”。

座殿老檐柱间，明、次三间全部装饰四抹头隔扇，以中二扇为门。隔扇下部裙板、绦环板与前门相同，上层是以双层八边格与正方格组成的棂花，明间横批图案为斜“卍”字锦加花瓣。座殿明间南檐下是“医德千秋”悬匾，边柱楹联——“医林探胜挖掘健康长寿瑰宝，药海索函采撷祛病延年良方”，与拜殿楹联呼应。寓意为，药物再灵验也没有奇特的药方医治想升官发财的世俗之病。封王封侯拒而不任的孙思邈，只想用精湛医术救百姓于水火之中。

药王殿整体结构，造型灵秀而不失雄伟，犹如大拜殿的左翼，起到了较好的陪衬作用。