民国初年，祀田没收为教育基金，祀事日渐废驰。

民国十七年（公元１９２８年），第五军二十四师（师长石友三）驻军南阳，拆毁医林会馆，又将祠墓辟为蔬圃。

公元1963年，河南省人民政府公布医圣祠为省级重点文物保护单位。

民国二十三年甲戌（公元１９３４年），道人李智祥募修大殿及西廊。（碑存）