禹州药商行帮会馆，在历史上曾经行使过如下管理职能：

1、研究帮会内以商业经营为主的事务。

这其中包括制定各种章程、规定统一的市场制度，对内裁决同业之间的纠纷，对外协调本籍商人与其他商人和地方乡绅的关系等。各个会馆都有自己的行规，十三帮会馆规定：“阖社公议，不许将庙中房屋借于外人使用，倘有本帮人私借外人者，罚酒席十桌。”怀帮会馆规定：“凡收徒弟，非亲友所托则拒；收为徒者，由二掌柜训示；做生意软似棉，能说千句话，不舍一分钱；十年读出个秀才，十年学不出买卖；生意何尝无学问，必须操心勤动脑；起早睡晚，打扫卫生；下苦功夫练写字，接待客人看眼色；上午搓纸捻、刷洗水烟袋，下午擦灯罩，晚上提前给掌柜和客人铺床叠被、提便壶等；一年学徒不能在柜台上营业，三年以内没工钱，四年开始年底给一次压岁钱和一顶绫子帽壳，成绩突出的再加一件大布衫。”

2、举行祭礼、庆典，组织庙会活动。

祭礼即祭关帝、药王、马王爷等，祭礼、庆典活动往往与演戏相结合，热闹非凡。禹州药市每年三会，每逢会期，祭祀、还愿、祝寿等都在会馆戏楼以以演戏的方式来庆贺，无论白天夜晚，锣鼓喧天。这不仅是帮内商家的娱乐享受，更是作为宣传自己、招徕顾客、活跃商业贸易的一种手段。

3、扩建、修葺会馆，管理会产。

会首负责会产管理，同时管理财务收支。会馆的收入主要是捐助、香资、房租、发放借贷及收取利息等。会馆的支出，主要有修缮费、祭祀费、演戏庆典活动费、日常接待费、节日宴请费、贫困救济费等。平时的收支多由会首负责经办，而用于修建筹集的资金，其收支数额较大的，由理事会统一研究。理事长由当地资金雄厚且有威望的商家担任。