1949年至今，随着国家经济建设形势的发展变化，百泉药材交流会有高潮，也有低谷。

建国后，中国共产党辉县委员会和辉县人民政府十分重视百泉药材交流会，于1950年春积极恢复。为加强领导，保证大会顺利进行，成立了百泉药材交流大会委员会，负责领导和处理一切事务，会期仍为一个月。之后，百泉药材交流会的发展，可以分为三个阶段：

1、1950年~1966年。此时期沿用药材交流与其他物资交易同时并举的历史传统，按照长期形成的各种货物分区，组织客商带货上会，公平交易，革除恶习，提倡新风。

2、1967年~1979年。1967年百泉药会的客商照常上会，但是具有悠久历史传统的盛会却被作为“四旧”加以“破除”，勒令停会。直到1979年，百泉药会停办长达12年。

3、1980年至今。

1980年春，辉县政府决定恢复百泉药材交流会，并立即成立百泉药材交流大会委员会。为使药交会适应当前经济形势，健康发展，委员会采取了一系列改革措施。首先，将药材交流与其他物资交流分离。每年公历3月举行药材交流会。会期为10天，其他物资交流会仍按照原来时间进行。在地点方面，药材交流会在百泉宾馆与共城宾馆举办，其他物资交流仍在原来地点举办。这一举措为药商提供了专用与宽松的交易场所。到会客商与货物剧增。

随着改革开放的不断深入，百泉药会的地位和作用越来越引起各级政府部门的关注。1980年被国家有关部门列为全国三大药会之一、十大药市之一。1981年，经辉县政府请示国家工商行政管理局批准，“每年在百泉、安国各召开一次全国性的药材交流会”。1990年1月24日，国家中医药管理局、国家计划委员会、卫生部、商业部、国家工商行政管理局、国家物价局六部委局在《关于整顿中药流通秩序的通知》中，再次明确：“全国性的中药交流会每年由中国药材公司召开两次，安国、百泉、樟树各召开一次。其他地区和单位均不得召开全国性的交流会。”百泉药会这一全国性药材交易盛会的地位，再次得以确立与巩固。